文/圖 半島全媒體記者 齊娟
青島市曾公布本輪新冠肺炎疫情的病毒基因組序列,公布疫情全基因測(cè)序結(jié)果與我國(guó)本土和入境人員病例基因庫(kù)比對(duì)情況。通報(bào)中,這些專業(yè)結(jié)論是如何得到的?新冠病毒全基因組測(cè)序工作又是如何開展的?日前,半島全媒體記者跟隨市疾病預(yù)防控制中心應(yīng)急檢測(cè)組,了解新冠病毒全基因組測(cè)序的方方面面。
確定基因型別
進(jìn)行新冠病毒基因溯源
來(lái)到青島市疾病預(yù)防控制中心的微生物檢驗(yàn)科,長(zhǎng)長(zhǎng)的走廊兩邊都是不同功能的實(shí)驗(yàn)室。根據(jù)工作劃分,實(shí)驗(yàn)室配備了核酸提取儀、核酸定量?jī)x、熒光定量PCR儀(基因擴(kuò)增儀)、普通PCR儀、全自動(dòng)分子診斷系統(tǒng)、全自動(dòng)分杯處理系統(tǒng)和二代測(cè)序儀等先進(jìn)儀器設(shè)備。
據(jù)工作人員介紹,市疾控中心承擔(dān)了全市新冠病毒疑似陽(yáng)性樣本的復(fù)核和全基因組測(cè)序工作。
“一旦全市醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)、第三方檢測(cè)機(jī)構(gòu)等具有新冠病毒核酸檢測(cè)資質(zhì)的單位篩查出陽(yáng)性的樣本,就會(huì)樣本送到市疾控中心新冠實(shí)驗(yàn)室。對(duì)于復(fù)核陽(yáng)性的首發(fā)病例、指示病例及入境人員病例的核酸樣本,我們會(huì)在第一時(shí)間進(jìn)行全基因組測(cè)序工作,來(lái)確定病毒的基因型別,并進(jìn)行新冠病毒基因溯源。”市疾控中心微生物檢驗(yàn)科主任、應(yīng)急檢測(cè)組組長(zhǎng)汪照國(guó)介紹道。
“國(guó)標(biāo)”72小時(shí)
青島最快24小時(shí)出結(jié)果
應(yīng)急檢測(cè)組成員劉思彤介紹,完成數(shù)據(jù)比對(duì)后,還要及時(shí)撰寫全基因組測(cè)序分析報(bào)告。
“每個(gè)病例基因組序列全長(zhǎng)多少,為奧密克戎變異株哪一進(jìn)化分支,與哪個(gè)首發(fā)或指示病例共享最多突變位點(diǎn),或又在此基礎(chǔ)上增加了哪個(gè)突變位點(diǎn),推斷可能與哪次疫情為同一傳播鏈?!眲⑺纪榻B,若青島的數(shù)據(jù)庫(kù)查無(wú)此例,則需要與省疾控、國(guó)家疾控的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。
“國(guó)家對(duì)新冠病毒測(cè)序工作要求的時(shí)長(zhǎng)是72小時(shí)出結(jié)果,經(jīng)過我們團(tuán)隊(duì)的不斷努力,可以40個(gè)小時(shí)完成樣品的接收、處理與分析工作。對(duì)于一些特殊的樣本,最快可以在24小時(shí)內(nèi)得到測(cè)序結(jié)果。全基因組測(cè)序工作在國(guó)家和省級(jí)專家的支持下,在青島市各級(jí)領(lǐng)導(dǎo)的關(guān)懷下,有了突飛猛進(jìn)的發(fā)展?!蓖粽諊?guó)說(shuō)道。
汪照國(guó)介紹,青島市疾控還具有第三代全基因組測(cè)序能力,“二代和三代測(cè)序技術(shù)相結(jié)合,能夠?yàn)橥话l(fā)公共衛(wèi)生事件中的全基因組測(cè)序工作設(shè)置‘雙保險(xiǎn)’。”
標(biāo)簽: 市疾控中心 病毒基因 突變位點(diǎn)
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清明假期南京有哪些景區(qū)可以踏青游玩?景區(qū)防疫政策是什么?記者為您來(lái)打探,希望大家在草長(zhǎng)鶯飛的美好春光里度過一個(gè)安全又輕松愉快的假期。
人間芳菲四月天,春和風(fēng)暖惜華年。萬(wàn)物可愛時(shí),盛景正清明。你好,四月!清明小長(zhǎng)假即將到來(lái),疫情之下你是否正發(fā)愁去哪玩好呢?其實(shí),不必遠(yuǎn)
3月31日,記者從省圖了解到,4月3日至5日清明節(jié)假期省圖書館不閉館。據(jù)悉,4月5日當(dāng)天開放時(shí)間為9:00—17:00,其余開放時(shí)間為9:00—19:30。
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清明假期即將到來(lái),出門踏青是不少市民的小長(zhǎng)假計(jì)劃。昨天,多家OTA發(fā)布了清明假期出游預(yù)訂數(shù)據(jù),受當(dāng)前多地疫情變化影響,游客出游半徑縮
2022年清明小長(zhǎng)假即將來(lái)臨,不少游客將近郊賞花踏青提上日程。3月30日,多家在線旅游平臺(tái)發(fā)布小長(zhǎng)假出游趨勢(shì)報(bào)告顯示,今年清明旅游市場(chǎng)以
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距離清明小長(zhǎng)假還有幾天,踏青賞花的好時(shí)節(jié),卻在最近放慢了春游出行的腳步。那么,清明小長(zhǎng)假可以安全出行嗎?還有哪些景區(qū)可以賞春游玩?大
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廣州市統(tǒng)計(jì)局發(fā)布的數(shù)據(jù)顯示,1~2月,廣州全社會(huì)用電量138 84億千瓦時(shí),同比增長(zhǎng)5 5%。其中,2月份,廣州春節(jié)后順利有序復(fù)工復(fù)產(chǎn),經(jīng)濟(jì)持續(xù)
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假幸存者之名雖可獲得一時(shí)流量卻丟了
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籃網(wǎng)球星杜蘭特近日接受了Theringer記者LoganMurdock的采訪,在采訪中他談到了自己目前的心態(tài)。“以前我總是太在意別人對(duì)我的期待。但現(xiàn)在,我
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今天上午8點(diǎn),活塞將對(duì)陣?yán)做?。賽前活塞主教練凱西談到了巴格利的情況:“他的的臀部有輕微的拉傷,沒有更新他什么時(shí)候可以回歸,但他今天將不
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省工信廳主辦焦化化工企業(yè)改造提升供需對(duì)接會(huì),主流媒體,山西門戶。山西新聞網(wǎng)是經(jīng)國(guó)務(wù)院新聞辦審核批準(zhǔn),由山西日?qǐng)?bào)報(bào)業(yè)集團(tuán)主管、主辦的山西
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“政銀企”攜手共助我省文旅市場(chǎng)主體紓困解難,主流媒體,山西門戶。山西新聞網(wǎng)是經(jīng)國(guó)務(wù)院新聞辦審核批準(zhǔn),由山西日?qǐng)?bào)報(bào)業(yè)集團(tuán)主管、主辦的山西
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今日NBA常規(guī)賽,國(guó)王隊(duì)將在客場(chǎng)挑戰(zhàn)火箭。賽前,國(guó)王主帥金特里接受了媒體采訪。談到戴維恩-米切爾,他說(shuō):“他是我執(zhí)教過的最努力的球員。”
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老鷹官方今日發(fā)布傷情更新,約翰-科林斯目前仍在進(jìn)行康復(fù)訓(xùn)練,何時(shí)可以開始場(chǎng)上籃球活動(dòng)要取決于后續(xù)診斷的結(jié)果科林斯遭遇了右腳拉傷、足底筋
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據(jù)名記TimMacMahon報(bào)道,獨(dú)行俠對(duì)爵士中鋒魯?shù)?戈貝爾非常感興趣,戈貝爾也會(huì)很喜歡和東契奇并肩作戰(zhàn)。該記者表示,雖然沒有跡象表明爵士計(jì)劃
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CBA季后賽12進(jìn)8,山西120-101戰(zhàn)勝?gòu)V州,大比分1-0領(lǐng)先。山西本場(chǎng)獲勝是2011-12賽季以來(lái)隊(duì)史季后賽首勝,當(dāng)時(shí)帶隊(duì)的主教練也是楊學(xué)增指導(dǎo)。在20
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