溯源“奧密克戎”:說(shuō)出你的秘密 揭秘市疾控新冠病毒基因測(cè)序?qū)嶒?yàn)室
發(fā)布時(shí)間：2022-04-02 14:03:23
文章來(lái)源：大眾報(bào)業(yè)·半島網(wǎng)
文/圖 半島全媒體記者 齊娟青島市曾公布本輪新冠肺炎疫情的病毒基因組序列,公布疫情全基因測(cè)序結(jié)果與我國(guó)本土和入境人員病例基因庫(kù)比對(duì)情況
文/圖 半島全媒體記者 齊娟
青島市曾公布本輪新冠肺炎疫情的病毒基因組序列,公布疫情全基因測(cè)序結(jié)果與我國(guó)本土和入境人員病例基因庫(kù)比對(duì)情況。通報(bào)中,這些專業(yè)結(jié)論是如何得到的?新冠病毒全基因組測(cè)序工作又是如何開展的?日前,半島全媒體記者跟隨市疾病預(yù)防控制中心應(yīng)急檢測(cè)組,了解新冠病毒全基因組測(cè)序的方方面面。
確定基因型別
進(jìn)行新冠病毒基因溯源
來(lái)到青島市疾病預(yù)防控制中心的微生物檢驗(yàn)科,長(zhǎng)長(zhǎng)的走廊兩邊都是不同功能的實(shí)驗(yàn)室。根據(jù)工作劃分,實(shí)驗(yàn)室配備了核酸提取儀、核酸定量?jī)x、熒光定量PCR儀(基因擴(kuò)增儀)、普通PCR儀、全自動(dòng)分子診斷系統(tǒng)、全自動(dòng)分杯處理系統(tǒng)和二代測(cè)序儀等先進(jìn)儀器設(shè)備。
據(jù)工作人員介紹,市疾控中心承擔(dān)了全市新冠病毒疑似陽(yáng)性樣本的復(fù)核和全基因組測(cè)序工作。
“一旦全市醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)、第三方檢測(cè)機(jī)構(gòu)等具有新冠病毒核酸檢測(cè)資質(zhì)的單位篩查出陽(yáng)性的樣本,就會(huì)樣本送到市疾控中心新冠實(shí)驗(yàn)室。對(duì)于復(fù)核陽(yáng)性的首發(fā)病例、指示病例及入境人員病例的核酸樣本,我們會(huì)在第一時(shí)間進(jìn)行全基因組測(cè)序工作,來(lái)確定病毒的基因型別,并進(jìn)行新冠病毒基因溯源。”市疾控中心微生物檢驗(yàn)科主任、應(yīng)急檢測(cè)組組長(zhǎng)汪照國(guó)介紹道。
“國(guó)標(biāo)”72小時(shí)
青島最快24小時(shí)出結(jié)果
應(yīng)急檢測(cè)組成員劉思彤介紹,完成數(shù)據(jù)比對(duì)后,還要及時(shí)撰寫全基因組測(cè)序分析報(bào)告。
“每個(gè)病例基因組序列全長(zhǎng)多少,為奧密克戎變異株哪一進(jìn)化分支,與哪個(gè)首發(fā)或指示病例共享最多突變位點(diǎn),或又在此基礎(chǔ)上增加了哪個(gè)突變位點(diǎn),推斷可能與哪次疫情為同一傳播鏈?！眲⑺纪榻B,若青島的數(shù)據(jù)庫(kù)查無(wú)此例,則需要與省疾控、國(guó)家疾控的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。
“國(guó)家對(duì)新冠病毒測(cè)序工作要求的時(shí)長(zhǎng)是72小時(shí)出結(jié)果,經(jīng)過我們團(tuán)隊(duì)的不斷努力,可以40個(gè)小時(shí)完成樣品的接收、處理與分析工作。對(duì)于一些特殊的樣本,最快可以在24小時(shí)內(nèi)得到測(cè)序結(jié)果。全基因組測(cè)序工作在國(guó)家和省級(jí)專家的支持下,在青島市各級(jí)領(lǐng)導(dǎo)的關(guān)懷下,有了突飛猛進(jìn)的發(fā)展?！蓖粽諊?guó)說(shuō)道。
汪照國(guó)介紹,青島市疾控還具有第三代全基因組測(cè)序能力,“二代和三代測(cè)序技術(shù)相結(jié)合,能夠?yàn)橥话l(fā)公共衛(wèi)生事件中的全基因組測(cè)序工作設(shè)置‘雙保險(xiǎn)’。”
標(biāo)簽： 市疾控中心 病毒基因 突變位點(diǎn)
樂活HOT
-
清明小長(zhǎng)假洛陽(yáng)王城公園推出豐富
清明小長(zhǎng)假即將到來(lái)，春光美，天氣宜，何不來(lái)一次賞花之旅?日前，王城公園溫控牡丹已成片開放，為豐富游客游園體驗(yàn)，該園還將在清明小長(zhǎng)假
-
南京歡樂谷4月3日起恢復(fù)開園 室
清明假期南京有哪些景區(qū)可以踏青游玩?景區(qū)防疫政策是什么?記者為您來(lái)打探，希望大家在草長(zhǎng)鶯飛的美好春光里度過一個(gè)安全又輕松愉快的假期。
-
2022清明小長(zhǎng)假河南最全“賞花地
人間芳菲四月天，春和風(fēng)暖惜華年。萬(wàn)物可愛時(shí)，盛景正清明。你好，四月!清明小長(zhǎng)假即將到來(lái)，疫情之下你是否正發(fā)愁去哪玩好呢?其實(shí)，不必遠(yuǎn)
-
清明節(jié)假期陜西省圖書館開放時(shí)間
3月31日，記者從省圖了解到，4月3日至5日清明節(jié)假期省圖書館不閉館。據(jù)悉，4月5日當(dāng)天開放時(shí)間為9:00—17:00，其余開放時(shí)間為9:00—19:30。
-
圓明園第二十七屆踏青節(jié)正式開幕
4月1日，圓明園第二十七屆踏青節(jié)正式開幕，游船和交通船也將正式開航。北京青年報(bào)記者獲悉，每年四五月份，圓明園景色尤佳，公園正式發(fā)布賞
-
2022年清明小長(zhǎng)假預(yù)計(jì)成都市自駕
昨日，高德地圖聯(lián)合全國(guó)多地交管部門發(fā)布了《2022年清明出行預(yù)測(cè)報(bào)告》，受高速免費(fèi)通行、清明掃墓、踏青賞花等多種出行因素影響，預(yù)計(jì)4月3
-
“小而美”酒店、精品民宿成為清
清明假期即將到來(lái)，出門踏青是不少市民的小長(zhǎng)假計(jì)劃。昨天，多家OTA發(fā)布了清明假期出游預(yù)訂數(shù)據(jù)，受當(dāng)前多地疫情變化影響，游客出游半徑縮
-
今年清明旅游市場(chǎng)以本地游為主
2022年清明小長(zhǎng)假即將來(lái)臨，不少游客將近郊賞花踏青提上日程。3月30日，多家在線旅游平臺(tái)發(fā)布小長(zhǎng)假出游趨勢(shì)報(bào)告顯示，今年清明旅游市場(chǎng)以
-
隋唐大運(yùn)河文化博物館展現(xiàn)大運(yùn)河
沉浸式體驗(yàn)成為文旅項(xiàng)目的主流標(biāo)配，裸眼3D、5G劇院、AR漫游等熱門事物，對(duì)一些人來(lái)說(shuō)已經(jīng)不算陌生。此時(shí)，一座新建的博物館該如何進(jìn)一步打
-
清明小長(zhǎng)假可以安全出行嗎？ 哪
距離清明小長(zhǎng)假還有幾天，踏青賞花的好時(shí)節(jié)，卻在最近放慢了春游出行的腳步。那么，清明小長(zhǎng)假可以安全出行嗎?還有哪些景區(qū)可以賞春游玩?大
娛樂LOVE
1~2月廣州第三產(chǎn)業(yè)用電量延續(xù)平穩(wěn)增
廣州市統(tǒng)計(jì)局發(fā)布的數(shù)據(jù)顯示，1~2月，廣州全社會(huì)用電量138 84億千瓦時(shí)，同比增長(zhǎng)5 5%。其中，2月份，廣州春節(jié)后順利有序復(fù)工復(fù)產(chǎn)，經(jīng)濟(jì)持續(xù)
深圳機(jī)場(chǎng)將進(jìn)一步加快客貨業(yè)務(wù)恢復(fù)和
記者從深圳寶安國(guó)際機(jī)場(chǎng)獲悉，根據(jù)民航航班換季安排，3月27日起，深圳機(jī)場(chǎng)開始執(zhí)行夏秋航季航班計(jì)劃，至10月29日結(jié)束。新航季，深圳機(jī)場(chǎng)將
北京繼續(xù)實(shí)施高峰時(shí)段區(qū)域限行交通管
昨天，北京青年報(bào)記者獲悉，為切實(shí)鞏固大氣污染治理成效，降低機(jī)動(dòng)車污染物排放，持續(xù)改善首都空氣質(zhì)量，北京市政府決定自2022年4月4日至20
北京購(gòu)房資格核驗(yàn)時(shí)限由10個(gè)工作日縮
昨日，北京青年報(bào)記者從市住建委獲悉，北京將推出購(gòu)房資格綠碼服務(wù)，市民實(shí)名注冊(cè)后提交購(gòu)房資格核驗(yàn)申請(qǐng)，核驗(yàn)申請(qǐng)?zhí)峤煌瓿珊蟀胄r(shí)內(nèi)出具
假幸存者之名雖可獲得一時(shí)流量卻丟了
據(jù)中國(guó)民航局消息，3月21日，東航一架波音737客機(jī)在執(zhí)行昆明——廣州航班任務(wù)時(shí)，于梧州上空失聯(lián)。目前，已確認(rèn)該飛機(jī)墜毀。機(jī)上人員共132
精彩推送
基德：吉諾比利是名勇士 他完全可以
據(jù)昨日?qǐng)?bào)道，馬刺名宿吉諾比利將在首輪投票后入選2022屆奈史密斯籃球名人堂。獨(dú)行俠主帥基德今日在接受媒體采訪時(shí)談到了吉諾比利，基德表示：
我省財(cái)政設(shè)立5大重點(diǎn)領(lǐng)域保障清單
我省財(cái)政設(shè)立5大重點(diǎn)領(lǐng)域保障清單,主流媒體,山西門戶。山西新聞網(wǎng)是經(jīng)國(guó)務(wù)院新聞辦審核批準(zhǔn)，由山西日?qǐng)?bào)報(bào)業(yè)集團(tuán)主管、主辦的山西省重點(diǎn)新聞網(wǎng)
我省將加大科研人員激勵(lì)力度
我省將加大科研人員激勵(lì)力度,主流媒體,山西門戶。山西新聞網(wǎng)是經(jīng)國(guó)務(wù)院新聞辦審核批準(zhǔn)，由山西日?qǐng)?bào)報(bào)業(yè)集團(tuán)主管、主辦的山西省重點(diǎn)新聞網(wǎng)站。
杜蘭特：我曾經(jīng)太在意別人的想法 奪
籃網(wǎng)球星杜蘭特近日接受了Theringer記者LoganMurdock的采訪，在采訪中他談到了自己目前的心態(tài)。“以前我總是太在意別人對(duì)我的期待。但現(xiàn)在，我
省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳、省鄉(xiāng)村振興局：部署農(nóng)
省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳、省鄉(xiāng)村振興局：部署農(nóng)村廁所革命暨村莊清潔行動(dòng),主流媒體,山西門戶。山西新聞網(wǎng)是經(jīng)國(guó)務(wù)院新聞辦審核批準(zhǔn)，由山西日?qǐng)?bào)報(bào)業(yè)集團(tuán)
凱西：巴格利臀部有輕微拉傷 不會(huì)為
今天上午8點(diǎn)，活塞將對(duì)陣?yán)做?。賽前活塞主教練凱西談到了巴格利的情況：“他的的臀部有輕微的拉傷，沒有更新他什么時(shí)候可以回歸，但他今天將不
吹響新號(hào)角！青島將實(shí)現(xiàn)11條地鐵新線
4月1日下午，青島市城市更新和城市建設(shè)二季度集中開工儀式在市北區(qū)歡樂濱海城跨國(guó)公司區(qū)域總部舉行。記者從李滄區(qū)和地鐵建設(shè)及沿線開發(fā)指揮部
省工信廳主辦焦化化工企業(yè)改造提升供
省工信廳主辦焦化化工企業(yè)改造提升供需對(duì)接會(huì),主流媒體,山西門戶。山西新聞網(wǎng)是經(jīng)國(guó)務(wù)院新聞辦審核批準(zhǔn)，由山西日?qǐng)?bào)報(bào)業(yè)集團(tuán)主管、主辦的山西
“政銀企”攜手共助我省文旅市場(chǎng)主體
“政銀企”攜手共助我省文旅市場(chǎng)主體紓困解難,主流媒體,山西門戶。山西新聞網(wǎng)是經(jīng)國(guó)務(wù)院新聞辦審核批準(zhǔn)，由山西日?qǐng)?bào)報(bào)業(yè)集團(tuán)主管、主辦的山西
金特里：戴維恩-米切爾是我執(zhí)教過最
今日NBA常規(guī)賽，國(guó)王隊(duì)將在客場(chǎng)挑戰(zhàn)火箭。賽前，國(guó)王主帥金特里接受了媒體采訪。談到戴維恩-米切爾，他說(shuō)：“他是我執(zhí)教過的最努力的球員。”
官方：科林斯仍未開始場(chǎng)上籃球活動(dòng)
老鷹官方今日發(fā)布傷情更新，約翰-科林斯目前仍在進(jìn)行康復(fù)訓(xùn)練，何時(shí)可以開始場(chǎng)上籃球活動(dòng)要取決于后續(xù)診斷的結(jié)果科林斯遭遇了右腳拉傷、足底筋
集中開工！青島重點(diǎn)低效片區(qū)（園區(qū)）
4月1日，青島市城市更新和城市建設(shè)攻堅(jiān)行動(dòng)二季度集中開工儀式在主會(huì)場(chǎng)市北區(qū)歡樂濱海城跨國(guó)公司區(qū)域總部集聚區(qū)項(xiàng)目現(xiàn)場(chǎng)舉辦，市有關(guān)領(lǐng)導(dǎo)出席
提前2小時(shí)到崗，只為集中隔離點(diǎn)書聲
書聲瑯瑯，不絕于耳，然而，這里不是教室，而是青島婦兒醫(yī)院接管的集中隔離醫(yī)學(xué)觀察場(chǎng)所。萊西疫情發(fā)生以來(lái)，每天清晨，十余名青少年準(zhǔn)時(shí)開啟
塔圖姆：比爾一直是我的完美榜樣 沒
近日，凱爾特人球星塔圖姆參加了勇士球星追夢(mèng)的播客節(jié)目《DraymondGreenShow》。談到與奇才球員比爾的關(guān)系，塔圖姆表示：“布拉德利（比爾）的
不只扣籃了！錫安賽前熱身練習(xí)急停中
今日上午10點(diǎn)30分，鵜鶘將做客洛杉磯挑戰(zhàn)湖人。鵜鶘隨隊(duì)記者WillGuillory放出了錫安進(jìn)行賽前熱身的視頻。錫安今天不再像此前視頻中只展現(xiàn)了扣
好兆頭！庫(kù)里今日出現(xiàn)在訓(xùn)練場(chǎng) 沒穿
勇士今日進(jìn)行了日常訓(xùn)練，多位隨隊(duì)記者在訓(xùn)練后放出了庫(kù)里出現(xiàn)在訓(xùn)練場(chǎng)的視頻。從視頻來(lái)看，庫(kù)里已脫掉了保護(hù)靴，行走狀態(tài)看起來(lái)也相當(dāng)不錯(cuò)。
斯瑪特：塔圖姆&布朗對(duì)我來(lái)說(shuō)還是孩
近日，凱爾特人球員斯瑪特接受了媒體采訪。談到隊(duì)友塔圖姆與布朗，斯瑪特表示：“我和那些孩子一起長(zhǎng)大，伙計(jì)，他們對(duì)我來(lái)說(shuō)還是孩子，就像我
名記：獨(dú)行俠對(duì)戈貝爾非常感興趣 后
據(jù)名記TimMacMahon報(bào)道，獨(dú)行俠對(duì)爵士中鋒魯?shù)?戈貝爾非常感興趣，戈貝爾也會(huì)很喜歡和東契奇并肩作戰(zhàn)。該記者表示，雖然沒有跡象表明爵士計(jì)劃
舊怨新仇，籃網(wǎng)跟雄鹿的東決級(jí)對(duì)決
這幾天在弄西部專篇，時(shí)間緊，任務(wù)重，比較難寫。今天隨便聊聊籃網(wǎng)和雄鹿這場(chǎng)。籃網(wǎng)和雄鹿是去年季后賽老對(duì)手，去年的事大家都清楚，不說(shuō)血海
楊學(xué)增：今天主要?jiǎng)僭谒枷牒托膽B(tài)上
CBA季后賽附加賽，山西120-101戰(zhàn)勝?gòu)V州，總比分1-0領(lǐng)先。賽后山西隊(duì)主帥楊學(xué)增接受了采訪。楊學(xué)增表示：“這是我們季后賽的第一場(chǎng)，比較難打。
加蘭德單月至少400分150助攻 歷史第
今日NBA常規(guī)賽，騎士隊(duì)客場(chǎng)107-131慘敗于老鷹。其中，騎士后場(chǎng)核心加蘭德出戰(zhàn)29分鐘，21投7中，三分4中1，罰球5中3，得到18分1籃板8助攻1搶斷1
山西取得近10年來(lái)的季后賽首勝 上一
CBA季后賽12進(jìn)8，山西120-101戰(zhàn)勝?gòu)V州，大比分1-0領(lǐng)先。山西本場(chǎng)獲勝是2011-12賽季以來(lái)隊(duì)史季后賽首勝，當(dāng)時(shí)帶隊(duì)的主教練也是楊學(xué)增指導(dǎo)。在20
美記：某些76人球員對(duì)老里不感冒 其
據(jù)NBA記者WosnyLambre在《TheRingerNBAShow》節(jié)目中透露，某些76人球員對(duì)老里弗斯及其執(zhí)教風(fēng)格不感冒。Lambre說(shuō)道：“我聽說(shuō)某些76人球員對(duì)老
恩比德本賽季第18次砍下至少35分10板
今日NBA常規(guī)賽，76人客場(chǎng)不敵活塞。76人球星恩比德全場(chǎng)出戰(zhàn)36分半，19投11中，三分球2中1，16罰14中空砍37分15板3助1斷2帽，同時(shí)出現(xiàn)了7次失誤
令人淚目！纏滿膠帶的“小白鞋”背后
“小白鞋”變臟兮兮的小黑鞋，松了的鞋帶粘上了膠帶……這張觸目驚心的照片背后，發(fā)生了怎樣的故事？鞋子的主人是誰(shuí)？她經(jīng)歷了什么？原來(lái)，這